วีดีโอ: ไฟล์ดัชนี BAM คืออะไร?
2024 ผู้เขียน: Lynn Donovan | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2023-12-15 23:54
NS ไฟล์ BAM (. แบม ) เป็นเวอร์ชันไบนารีของ SAM ไฟล์ . แซม ไฟล์ (. sam) เป็นข้อความที่คั่นด้วยแท็บ ไฟล์ ที่มีข้อมูลการจัดตำแหน่งลำดับ การจัดทำดัชนี : IGV กำหนดให้ทั้ง SAM และ ไฟล์ BAM เรียงตามตำแหน่งและ จัดทำดัชนี และที่ ไฟล์ดัชนี ทำตามแบบแผนการตั้งชื่อเฉพาะ
เช่นเดียวกัน มีคนถามว่าจะเปิดไฟล์ BAM ได้อย่างไร?
จาก ไฟล์ เลือกเมนู เปิด และเลือก ไฟล์ BAM จากด้านซ้าย เลือกปุ่มทางด้านขวาที่ระบุว่าเพิ่ม ไฟล์ BAM . นำทางไปยัง แบม ทดสอบ ไฟล์ โฟลเดอร์ที่คุณดาวน์โหลด เลือก with_index_with_graph คลิก เปิด , เลือกแผนที่
ประการที่สอง ฉันจะแปลงไฟล์ BAM เป็น Fastq ได้อย่างไร ด้านล่างนี้เป็นขั้นตอนในการแปลงไฟล์ BAM เป็นรูปแบบ FASTQ ซึ่งจะทำงานบน Linux และจะต้องใช้ SAMTOOLS และ BEDTOOLS
- ดาวน์โหลด SAMTOOLS.dll
- แตกไฟล์โดยใช้คำสั่ง tar xzvf samtools-version.tar.bz2
- มันจะสร้างโฟลเดอร์โดยใช้ชื่อ samtools-version
- ย้ายไปยังไดเร็กทอรี cd samtools-version
ฉันจะแปลงไฟล์ BAM เป็นไฟล์ SAM ได้อย่างไร
ถึง แปลง SAM ถึง แบม เราใช้คำสั่ง samtools view เราต้องระบุว่าอินพุตของเราอยู่ใน รูปแบบ SAM (โดยค่าเริ่มต้นมันคาดว่า แบม ) โดยใช้ตัวเลือก -S เรายังต้องบอกว่าเราต้องการให้ผลลัพธ์เป็น แบม (โดยค่าเริ่มต้นมันผลิต แบม ) ด้วยตัวเลือก -b
มุมมอง Samtools ทำอะไร?
Samtools เป็นชุดของยูทิลิตี้ที่จัดการการจัดตำแหน่งในรูปแบบ BAM มันนำเข้าและส่งออกไปยังรูปแบบ SAM (การจัดตำแหน่งลำดับ/แผนที่) ทำ การเรียงลำดับ การรวม และการทำดัชนี และช่วยให้สามารถดึงข้อมูลการอ่านในภูมิภาคต่างๆ ได้อย่างรวดเร็ว Samtools ถูกออกแบบให้ทำงานบนสตรีม
แนะนำ:
คำสั่ง TU คืออะไร?
ภาพรวม คำสั่ง Tú เป็นรูปแบบเอกพจน์ของคำสั่งที่ไม่เป็นทางการ คุณสามารถใช้คำสั่ง tú ยืนยันเพื่อบอกเพื่อน สมาชิกในครอบครัวที่อายุเท่ากับคุณหรือน้อง เพื่อนร่วมชั้น เด็ก หรือสัตว์เลี้ยงให้ทำอะไรบางอย่างได้ ในการบอกคนอื่นว่าอย่าทำอะไร คุณจะใช้คำสั่งลบ tú
คุณภาพเสียงของ Spotify คืออะไร?
จนถึงปัจจุบัน Spotify ได้บีบอัดไฟล์เสียงลงเหลือ 160 kbps บนเดสก์ท็อปหรือ 96 kbps บนอุปกรณ์มือถือ Spotify เรียกอัตรานี้ว่า "ปกติ" สมาชิกแบบชำระเงินยังมีตัวเลือก "คุณภาพสูง" ของเสียง 320kbps บนเดสก์ท็อป เสียงที่มีความเที่ยงตรงสูงหรือแบบไม่สูญเสียข้อมูลมีบิตเรตที่สูงขึ้นอย่างเห็นได้ชัดที่ 1,411 kbps
ห้องสมุด SWT คืออะไร?
Standard Widget Toolkit (SWT) เป็นไลบรารีส่วนต่อประสานผู้ใช้ดีฟอลต์ที่ใช้โดย Eclipse มันมีวิดเจ็ต เช่น ปุ่มและฟิลด์ข้อความ ใช้วิดเจ็ตดั้งเดิมของแพลตฟอร์มทุกครั้งที่ทำได้ วิดเจ็ตดั้งเดิมของระบบปฏิบัติการเข้าถึงได้โดยเฟรมเวิร์ก SWT ผ่านเฟรมเวิร์ก Java Native Interface (JNI)
การทำแผนที่ XML คืออะไร?
แมป XML เป็นวิธีที่ Excel แสดงถึงสคีมา xml ภายในเวิร์กบุ๊ก Excel ใช้แผนที่เป็นวิธีการผูกข้อมูลจากไฟล์ xml กับเซลล์และช่วงบนเวิร์กชีต คุณสามารถส่งออกข้อมูลจาก Excel ไปยัง XML ได้โดยใช้แมป XML เท่านั้น ถ้าคุณได้เพิ่มแมป XML ลงในเวิร์กชีต คุณสามารถนำเข้าข้อมูลไปยังแผนที่นั้นได้ตลอดเวลา
W3c คืออะไร Whatwg คืออะไร?
คณะทำงานเทคโนโลยี Web Hypertext Application Technology (WHATWG) เป็นชุมชนของผู้ที่สนใจในการพัฒนา HTML และเทคโนโลยีที่เกี่ยวข้อง WHATWG ก่อตั้งขึ้นโดยบุคคลจาก Apple Inc., Mozilla Foundation และ Opera Software ซึ่งเป็นผู้จำหน่ายเว็บเบราว์เซอร์ชั้นนำในปี 2547